Genomica integrata

Descrizione

Genomica integrata è il risultato di un corso di laboratorio di gran successo tenuto negli ultimi sei anni presso l’Università dell’Alabama. Il corso è stato in origine progettato per onorare le aspettative formative dell’Howard Hughes Medical Institute Undergraduate Biological Sciences Education Program Grant assegnato all’Università dell’Alabama e poi è stato modificato con il sostegno del National Science Foundation CAREER program. Entrambe queste istituzioni condividono il comune obiettivo di incorraggiare la pedagogia basata sulla ricerca e modernizzare l’insegnamento delle scienze biologiche. Questo testo fornisce all’insegnante una strategia innovativa con la quale presentare un esperimento basato sulla scoperta ai propri studenti. Genomica integrata rappresenta un continuum di esercitazioni organizzato, sebbene flessibile, in cui i concetti basilari di microbiologia, genetica, biologia molecolare, genomica, proteomica e bioinformatica sono inseriti in una serie di esperimenti per i quali i risultati non sono predeterminati. L’impiego di semplici organismi modello come batteri, lievito e vermi in questo corso non solo mantiene basso il costo globale del programma di esercitazioni, ma allo stesso tempo introduce gli studenti all’unitarietà della funzione biologica ed al valore della genomica comparata. Inequivocabilmente la pedagogia basata sulla scoperta è una sfida, ma è raccolta con entusiasmo dagli insegnanti più ambiziosi, in quanto la ricompensa è enorme sia per l’insegnante che per gli studenti. A tal proposito, il disegno sperimentale di Genomica integrata è ben adattato e permette all’insegnante di interagire velocemente con geni e proteine. Sommario 1. Introduzione alle tecniche genetiche di base di laboratorio 2. Analisi dell’espressione genica utilizzando animali transgenici 3. Creazione e test di lieviti transgenici e loro utilizzazione in screening di interazioni proteina-proteina 4. Screening con il metodo due-ibridi di lievito 5. Isolamento ed identificazione delle proteine interagenti 6. L’uso della bioinformatica nella ricerca moderna 7. Generazione di un vettore per RNAi 8. Interferenza mediata da RNA indotta da ingestione di batteri Appendice I. Clonaggio mediante ricombinazione Appendice II. Ricette e preparazione dei terreni di coltura Appendice III. Tecniche sterili e protocolli per la manipolazione di vermi Appendice IV. Fenotipi mutanti di C. elegans Appendice V. Mappe dei vettori Supporti per docenti I docenti che utilizzano il testo a scopo didattico possono richiedere il materiale iconografico del volume al fine di preparare presentazioni in Power Point o stampare lucidi ad alta definizione.